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Extraction de données des essais cliniques

Description

Le consommateur réalise une extraction des essais cliniques à partir de critères de recherche.

Le SI répond au consommateur les essais cliniques correspondant aux critères de recherche et les ressources liées.

Caractéristiques de l’API

Construction de la requête de base

Construction de la réponse de base

Réponse de base – Succès

Lien vers la spécification FHIR : http://hl7.org/fhir/R4/bundle.html

Si la recherche est un succès, le serveur répond :

• Un header avec un code 200 OK HTTP.
• Un body contenant une ressource Bundle dont le type = searchset. Le bundle encapsule 0 à n ressources ResearchStudy corespondant aux critères de recherche plus les ressources incluses correspondant aux critères de recherche. Le service développé renvoie par défaut les 20 premiers résultats et indique le total trouvé dans une balise total. Dans le cas où il n’y a pas de résultat le service renvoie total: 0. Le nombre de résultats renvoyés peut être modifié en utilisant le modificateur de requête _count, avec une valeur maximale de 5000.

Remarque : La recherche est un succès à partir du moment où la requête peut être exécutée. Il peut il y avoir 0 à n correspondances.

Plus de précision sur la spécification FHIR : http://hl7.org/fhir/R4/http.html

Réponse de base – Echec

Lien vers la spécification FHIR : http://hl7.org/fhir/R4/operationoutcome.html

Si la recherche échoue, le serveur doit répondre :

• Un header avec un un code erreur HTTP 4XX ou 5XX.
• Un body contenant une ressource OperationOutcome qui donne les détails sur la raison de l’échec.

Remarque : L’échec d’une recherche est la non-possibilité d’exécuter la requête, ce qui est différent d’aucune correspondance à la recherche.

Plus de précision sur la spécification FHIR : http://hl7.org/fhir/R4/http.html

Critères de recherche

• Les critères de recherche, définis au paragraphe dédié, de StructureDefinition-eclaire-researchstudy applicables à ce cas d’usage sont :

Paramètres et modificateurs de requêtes FHIR

Les paramètres et modificateurs de requêtes décrits au paragraphe dédié applicables à ce cas d’usage sont :

• _include
• _count, _sort
• _content, _text
• Tous les prefixes de comparaison

Exemple de requêtes

Scénario 1 : Extraction complète des essais cliniques

Description du scénario : Un consommateur souhaite récupérer tous les essais cliniques recensés sur le périmètre national.

Requête :

GET [BASE]/ResearchStudy?_include=ResearchStudy:site&_include=ResearchStudy:sponsor&_include=ResearchStudy:enrollment

Requête expliquée :

GET [BASE]/ResearchStudy? # Recherche sans critère pour récupérer tous les essais cliniques
_include=ResearchStudy:site # Inclus les Location référencées par ResearchStudy
&_include=ResearchStudy:sponsor # Inclus les Organization référencées par ResearchStudy
&_include=ResearchStudy:enrollment # Inclus les Group référencées par ResearchStudy

Scénario 2 : Extraction des essais cliniques à partir d’une date de mise à jour

Description du scénario : Un consommateur souhaite mettre à jour tous les essais cliniques mis à jour depuis une certaine date >= (06/11/2022).

Requête :

GET [BASE]/ResearchStudy?_lastUpdated=ge2022-11-06T15:00&_include=ResearchStudy:site&_include=ResearchStudy:sponsor&_include=ResearchStudy:enrollment

Requête expliquée :

GET [BASE]/ResearchStudy?_lastUpdated=ge2022-11-06T15:00 # Critère de recherche sur la date de mise à jour (ge = greater or equal)
&_include=ResearchStudy:site # Inclus les Location référencées par ResearchStudy
&_include=ResearchStudy:sponsor # Inclus les Organization référencées par ResearchStudy
&_include=ResearchStudy:enrollment # Inclus les Group référencées par ResearchStudy